协议期于今年三月初实习期结束，由于未…

协议期于今年三月初实习期结束，由于未毕业，公司说先签一份协议书，说协议期结束，毕业证拿到后签正式合同，并规定如果违约赔偿5000块，经过这段时间的相处发现越来越不能在这个公司待了如果协议期结束，不签定正式合同的话，是不是就要赔偿啊？